Programmatūras saraksts

Šajā lapā ir sniegts saraksts ar programmām un bibliotēkām, kas ir uzinstalētas uz Rīgas Tehniskās Universitātes un Latvijas Universitātes Skaitliskās Modelēšanas Institūta klasteriem. Sazinoties ar Latvijas HPC kompetences centru, iespējams uzdot jautājumus par šīm programmām vai uzzināt par citu programmu instalēšanas iespējām.

Rīgas Tehniskās Universitātes klasteris

Nosaukums	Versija	Kategorija
Apptainer	1.1.6	Konteinerizācijas risinājumi
Singularity	3.11.4	Konteinerizācijas risinājumi
Alphafold	2.3.2	Mākslīgā intelekta bibliotēkas
PyTorch	1.13.1	Mākslīgā intelekta bibliotēkas
TensorFlow	2.3.1	Mākslīgā intelekta bibliotēkas
PyCharm	2020.2.3	Programmēšanas vides (IDE)
Cuda*	12.4	Paralēlo aprēķinu biblitēkas
openmpi	4.1.1	Paralēlo aprēķinu biblitēkas
GCC	11.2	Programmēšanas valodas un kompilatori
Java	21.0.2	Programmēšanas valodas un kompilatori
MATLAB	R2024a	Programmēšanas valodas un kompilatori
nvhpc	21.9	Programmēšanas valodas un kompilatori
Python**	3.9.16	Programmēšanas valodas un kompilatori
R	4.32	Programmēšanas valodas un kompilatori
Scilab	5.4	Programmēšanas valodas un kompilatori
Gaussian	g09_d01	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
Gromacs	2022.3	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
GULP	6.1.2	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
MOPAC	2016	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
NWChem	7.0.2	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
ORCA	4.2.1	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
PyMOL	2.5.0	Skaitliskās ķīmijas programmatūra
Ansys	2023-R1	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Code_aster	14.4	Skaitlisko simulāciju programmatūra
COMSOL	5.3	Skaitlisko simulāciju programmatūra
FreeFEM	4.10	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Geant4	11.0.1	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Gmsh	4.11	Skaitlisko simulāciju programmatūra
NAMD	2.14	Skaitlisko simulāciju programmatūra
OpenFOAM	5.0	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Peridigm	1.5	Skaitlisko simulāciju programmatūra
PLUMED	2.7.2	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Schrödinger	2023-2	Skaitlisko simulāciju programmatūra
fftw	3.3.10	Skaitļošanas bibliotēkas
OpenBLAS	0.3.5	Skaitļošanas bibliotēkas
Gnuplot	4.6	Datu vizualizācijas rīki
Knime	5.1.2	Datu vizualizācijas rīki
BEDTools	2.29.2	Genoma apstrādes programmatūra
Bowtie 2	2.4.2	Genoma apstrādes programmatūra
Bracken	2.5	Genoma apstrādes programmatūra
rRNAFilter	1.1	Genoma apstrādes programmatūra
Samtools	1.1	Genoma apstrādes programmatūra
GDAL	3.2.1	Ģeotelpisku datu apstrāde
GEOS	3.9.0	Ģeotelpisku datu apstrāde

LU Skaitliskās Modelēšanas Institūta klasteris

Nosaukums	Versija	Kategorija
openmpi	4.1.1	Paralēlo aprēķinu biblitēkas
Cuda	11.6	Paralēlo aprēķinu biblitēkas
Salome	9.6.0	CAD programmatūra
Singularity	3.7.1-5.1.ohpc.2.1	Konteinerizācijas risinājumi
Python*	3.11.5	Programmēšanas valodas un kompilatori
R	4.1.2	Programmēšanas valodas un kompilatori
Julia	1.7.0	Programmēšanas valodas un kompilatori
Lazarus	2.2.0-rc2	Programmēšanas valodas un kompilatori
Sqlite	3.38.1	Programmēšanas valodas un kompilatori
GCC	11.2	Programmēšanas valodas un kompilatori
OpenFOAM**	12; v2312	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Copasi	4.33	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Elmer***	9.0	Skaitlisko simulāciju programmatūra
FreeFEM	4.10	Skaitlisko simulāciju programmatūra
GetDP	3.4	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Gmsh	4.8.4	Skaitlisko simulāciju programmatūra
Bioconda		Skaitlisko simulāciju programmatūra
fftw	3.3.8	Skaitļošanas bibliotēkas
PetSC	3.16.1	Skaitļošanas bibliotēkas
Eigen	3.4	Skaitļošanas bibliotēkas
OpenBLAS	0.3.26	Skaitļošanas bibliotēkas
samtools	1.21	Skaitļošanas bibliotēkas
ParaView	5.11.2	Datu vizualizācijas rīki
Gnuplot	5.2.4	Datu vizualizācijas rīki
Extrae	3.7.0	Profilēšanas rīki
ScoreP	6	Profilēšanas rīki
CubeGUI	4.7	Profilēšanas rīki